MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D9 chromosome

Total Repeats: 36698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017620	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583128
2	NC_017620	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	386583128
3	NC_017620	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	386583128
4	NC_017620	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	386583128
5	NC_017620	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583128
6	NC_017620	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583128
7	NC_017620	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386583128
8	NC_017620	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386583128
9	NC_017620	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583128
10	NC_017620	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583128
11	NC_017620	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583128
12	NC_017620	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	386583128
13	NC_017620	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386583128
14	NC_017620	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583128
15	NC_017620	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	386583128
16	NC_017620	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386583128
17	NC_017620	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583128
18	NC_017620	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583128
19	NC_017620	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	386583128
20	NC_017620	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583128
21	NC_017620	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386583128
22	NC_017620	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386583128
23	NC_017620	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583128
24	NC_017620	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	386583128
25	NC_017620	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	386583128
26	NC_017620	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386583128
27	NC_017620	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386583128
28	NC_017620	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386583128
29	NC_017620	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386583128
30	NC_017620	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583128
31	NC_017620	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	386583128
32	NC_017620	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386583129
33	NC_017620	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	386583129
34	NC_017620	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583129
35	NC_017620	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583129
36	NC_017620	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386583129
37	NC_017620	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583129
38	NC_017620	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583129
39	NC_017620	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583129
40	NC_017620	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	386583129
41	NC_017620	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583129
42	NC_017620	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386583129
43	NC_017620	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386583129
44	NC_017620	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583129
45	NC_017620	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386583129
46	NC_017620	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	386583129
47	NC_017620	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583129
48	NC_017620	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386583129
49	NC_017620	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386583129
50	NC_017620	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583129
51	NC_017620	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386583129
52	NC_017620	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386583129
53	NC_017620	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386583129
54	NC_017620	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386583129
55	NC_017620	TA	4	8	2915	2922	50 %	50 %	0 %	0 %	386583130
56	NC_017620	CTG	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583130
57	NC_017620	CATAT	2	10	2959	2968	40 %	40 %	0 %	20 %	386583130
58	NC_017620	AAAG	2	8	2977	2984	75 %	0 %	25 %	0 %	386583130
59	NC_017620	A	6	6	3035	3040	100 %	0 %	0 %	0 %	386583130
60	NC_017620	AGT	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583130
61	NC_017620	TTA	2	6	3159	3164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583130
62	NC_017620	AT	3	6	3259	3264	50 %	50 %	0 %	0 %	386583130
63	NC_017620	A	7	7	3355	3361	100 %	0 %	0 %	0 %	386583130
64	NC_017620	ATT	2	6	3417	3422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583130
65	NC_017620	TGA	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583130
66	NC_017620	T	6	6	3487	3492	0 %	100 %	0 %	0 %	386583130
67	NC_017620	TGG	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583130
68	NC_017620	GAAG	2	8	3561	3568	50 %	0 %	50 %	0 %	386583130
69	NC_017620	TTA	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583130
70	NC_017620	TCT	2	6	3649	3654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386583130
71	NC_017620	ATT	3	9	3708	3716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583130
72	NC_017620	GA	3	6	3728	3733	50 %	0 %	50 %	0 %	386583130
73	NC_017620	GTAT	2	8	3776	3783	25 %	50 %	25 %	0 %	386583130
74	NC_017620	AGG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386583130
75	NC_017620	GTAT	2	8	3797	3804	25 %	50 %	25 %	0 %	386583131
76	NC_017620	TCA	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583131
77	NC_017620	AAG	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583131
78	NC_017620	ATG	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583131
79	NC_017620	A	6	6	3968	3973	100 %	0 %	0 %	0 %	386583131
80	NC_017620	TGG	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583132
81	NC_017620	AAC	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583132
82	NC_017620	AATG	2	8	4342	4349	50 %	25 %	25 %	0 %	386583132
83	NC_017620	GAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583132
84	NC_017620	CT	3	6	4415	4420	0 %	50 %	0 %	50 %	386583132
85	NC_017620	CAG	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583133
86	NC_017620	TCG	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583133
87	NC_017620	TGG	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583133
88	NC_017620	TCA	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583133
89	NC_017620	AAAT	2	8	4843	4850	75 %	25 %	0 %	0 %	386583133
90	NC_017620	TTG	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583133
91	NC_017620	AG	3	6	5005	5010	50 %	0 %	50 %	0 %	386583133
92	NC_017620	CAA	2	6	5014	5019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583133
93	NC_017620	A	6	6	5037	5042	100 %	0 %	0 %	0 %	386583133
94	NC_017620	A	6	6	5094	5099	100 %	0 %	0 %	0 %	386583133
95	NC_017620	AGA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583133
96	NC_017620	GAA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583133
97	NC_017620	A	6	6	5160	5165	100 %	0 %	0 %	0 %	386583133
98	NC_017620	GTG	3	9	5303	5311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583133
99	NC_017620	GAA	3	9	5327	5335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583133
100	NC_017620	CGA	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583133
101	NC_017620	CTTG	2	8	5431	5438	0 %	50 %	25 %	25 %	386583133
102	NC_017620	CAG	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583133
103	NC_017620	AGG	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386583133
104	NC_017620	CTC	2	6	5508	5513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386583133
105	NC_017620	GAT	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583133
106	NC_017620	AAG	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583133
107	NC_017620	GAA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583133
108	NC_017620	CAT	2	6	5671	5676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583133
109	NC_017620	A	6	6	5851	5856	100 %	0 %	0 %	0 %	386583134
110	NC_017620	ATC	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583134
111	NC_017620	AAACA	2	10	5905	5914	80 %	0 %	0 %	20 %	386583134
112	NC_017620	TGC	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583134
113	NC_017620	A	6	6	6022	6027	100 %	0 %	0 %	0 %	386583134
114	NC_017620	TCTA	2	8	6028	6035	25 %	50 %	0 %	25 %	386583134
115	NC_017620	TTA	2	6	6092	6097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583134
116	NC_017620	TAG	2	6	6121	6126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583134
117	NC_017620	ATG	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583134
118	NC_017620	TGG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583134
119	NC_017620	AGA	2	6	6317	6322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583134
120	NC_017620	GAA	2	6	6381	6386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583134
121	NC_017620	GAT	2	6	6387	6392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583134
122	NC_017620	ATCA	2	8	6461	6468	50 %	25 %	0 %	25 %	386583135
123	NC_017620	TAT	2	6	6504	6509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583135
124	NC_017620	AAT	2	6	6574	6579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386583135
125	NC_017620	ATG	2	6	6600	6605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583135
126	NC_017620	TAG	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583135
127	NC_017620	ATT	2	6	6635	6640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583135
128	NC_017620	T	6	6	6662	6667	0 %	100 %	0 %	0 %	386583135
129	NC_017620	GAT	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583135
130	NC_017620	GTTT	2	8	6691	6698	0 %	75 %	25 %	0 %	386583135
131	NC_017620	TCAA	2	8	6718	6725	50 %	25 %	0 %	25 %	386583135
132	NC_017620	CTA	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583135
133	NC_017620	GCT	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583135
134	NC_017620	AAT	2	6	6884	6889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386583135
135	NC_017620	A	6	6	6908	6913	100 %	0 %	0 %	0 %	386583135
136	NC_017620	T	6	6	7007	7012	0 %	100 %	0 %	0 %	386583135
137	NC_017620	GAGAT	2	10	7014	7023	40 %	20 %	40 %	0 %	386583135
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